渔业污染事故调查机构是以养殖证为受理案件的基础，养殖证登记内容是调查处理事故的重要依据。经审核，对符合规定的，渔业行政主管部门应报请有审批权的人民政府批准，颁发养殖证。四集体所有或全民所有由农业集体经济组织使用的海域和内陆水域，承包人按规定签定承包合同后，到所辖地县级以上人民政府进行注册登记，领取养殖证。
养殖三大证件
养殖三大证件是：动物防疫条件合格证；兴建养殖档案；养殖场、养殖小区备案登记证。
动物防疫条件合格证是单位和个人开办动物饲养场、养殖小区、动物隔离场所、动物屠宰加工场以及动物和动物产品无害化处理场的生产经营活动；经兽医管理部门审查，符合动物疫病预防、控制、扑灭等条件批准后，发给的动物防疫条件许可凭证。有注册备案的许可证号。
根据2010年1月4日农业部第一次常务会议审议通过，于2010年5月1日起施行的《动物防疫条件审查办法》规定，“动物饲养场、养殖小区、动物隔离场所、动物屠宰加工场所以及动物和动物产品无害化处理场所，应当符合本办法规定的动物防疫条件，并取得《动物防疫条件合格证》。”“经营动物和动物产品的集贸市场应当符合本办法规定的动物防疫条件。”
养殖许可证的作用主要有：
1、养殖证是养鱼生产者使用水域、滩涂从事养殖生产活动的合法权益，能够得到法律的保护，养殖证是合法的凭证。
2、养殖证是判断水域养殖使用功能的基础依据，当养殖水域因国家建设及其它项目征用或受到污染、爆破造成损失时，养殖者可凭养殖证申请补偿或进行索赔。渔业污染事故调查机构是以养殖证为受理案件的基础，养殖证登记内容是调查处理事故的重要依据。
3、水产养殖生产者要持养殖证才能够申请苗种生产审批、水生野生动物驯养繁殖证，水产品原产地证书，无公害农产品基地资格等，并享受国家税收等方面的优惠政策。
养殖业需要什么证件
1、土地手续.需要办理生产设施用地的备案手续，签订用地协议在国土局和农业局备案。养殖场的选址还需通过规划局的审批。2、环境影响评价(环评手续).从选址到最终养殖场生产运行整个流程都需要通过环评进行认定和分析预测，需要配套建设污染防治设施。环评手续需到环保局办理。
3、排污许可证.《畜禽养殖污染防治管理办法》第十条规定，在依法实施污染物排放总量控制的区域内，畜禽养殖场必须按规定取得《排污许可证》，并按照《排污许可证》的规定排放污染物。
4、动物防疫条件合格证.根据《动物防疫法》规定需要办理动物防疫条件合格证。《动物防疫条件合格证》要到畜牧局办理，没有这个证件是不能从事养殖业的。该证审批下来后，从事一般畜禽养殖的养殖户就可以去工商局办理营业执照，然后到畜牧局办理登记备案手续，开启自己的养殖之路。
5、养殖证.《养殖证》是国家要求海域水产养殖和内陆水域养殖户需要办理的一种证件，利用海域和内陆水域从事养殖生产活动的单位和个人，必须依法取得《养殖证》
6、野生动物驯养繁殖许可证.驯养繁殖野生动物需要办理《国家重点保护野生动物驯养繁殖许可证》。比如养孔雀、野猪等野生动物的越来越多需要办理这个。
7、办理工商登记.具备了上述所需证件后，养殖户就可以去工商局申请工商登记，办理营业执照了。
8、备案手续.养殖户取得营业执照后需要到畜牧局办理养殖场备案登记手续。